При гіпертрофічній кардіоміопатії (ГКМП) стінка лівого шлуночка аномально збільшена за рахунок надмірного потовщення, в той час як розміри порожнини лівого шлуночка зазвичай нормальних або зменшених розмірів. ГКМП завжди асоціювали зі «збільшеним серцем», проте більш точно і правильно його слід назвати «потовщеним» або «м’язовим» серцем. Кардіологи можуть дати визначення такому серцю як «гіпертрофоване-недилатоване». Поширення м’язового потовщення (гіпертрофії) може проявлятися різними формати і варіюватися у різних пацієнтів (навіть серед родичів). Певна форма, чітке місце або ступінь гіпертрофії можуть значно відрізнятися серед пацієнтів.

На додачу, абсолютна товщина стінки також може варіюватися серед різних пацієнтів. При ГКМП товщина м’язу може значно перевищувати таку, що трапляється при інших кардіологічних захворюваннях, складаючи до шести разів більше норми. Верхня межа нормальної товщини становить 10-12 мм, а, що вражає, у деяких пацієнтів ця величина налічує 40-60 мм. Також, може зустрічатися аномальний розмір і функціонування мітрального клапана та розташування папілярних м’язів. Більшість анатомічних аномалій серця локалізуються у лівому шлуночку, хоча численна кількість пацієнтів з ГКМП можуть мати і збільшення правого передсердя, а також, зрідка, гіпертрофію правого шлуночка.